De toekenning van de beheerspremie verloopt in twee fases. Eerst dient u een aanvraagdossier in op basis waarvan de toekenning van de premie principieel wordt goedgekeurd. De definitieve bepaling van het bedrag van de premie en de uitbetaling gebeurt pas nadat u een gunningsdossier met bewijsstukken indient.De aanvraag kan gelijktijdig worden ingediend met de
melding van handelingen aan het voorlopig of definitief beschermd vaartuig.Agentschap Onroerend Erfgoed onderzoekt uw aanvraag inhoudelijk en neemt binnen de negentig dagen een beslissing. Als het dossier inhoudelijk wordt goedgekeurd, kan de minister een beheerspremie toekennen. Onroerend Erfgoed brengt u schriftelijk op de hoogte van de toekenning.U mag pas met de werken starten nadat de premie is toegekend.Na de toekenning van de premie bezorgt u een gunningsdossier. Daarin concretiseert u de werken en de uitvoerder(s) ervan. Op basis van het dossier wordt het definitieve premiebedrag bepaald.